Майбутній василіянин-душпастир, василіянин-історик та василіянин-публіцист народився 1 березня 1922 р. у місті Перечині на Закарпатті.
Священичі свячення отримав 24 березня 1946 р., до Василіянського Чину вступив 22 березня 1956 р., тимчасові монаші обіти склав 10 червня 1957 р., вічні – 19 червня 1960 р.
Навчався в Ужгородській гімназії, яку закінчив у 1940 р. Серед його викладачів у цьому закладі були Іван Панькевич, Володимир Бірчак та інші діячі українського національного відродження Закарпаття. Відтак юнак вступив до української гімназії св. Йосафата в Римі і папського університету «Урбаніум». В останньому, 27 червня 1947 р. захистив дисертацію латинською мовою «De erectione canonica Eparchiae Mukačoviensis» і здобув науковий ступінь доктора теології. Ця дисертація була опублікована 1956 р., у 1-ій секції «Записок ЧСВВ».
Ще з 1948 р. о. Пекар служив у США як священик (1948–1950) і професор у семінарії св. Кирила і Методія у Пітсбурзі (1950–1956). У 1956–1960 рр. викладав українську мову у монастирській школі в Мондері, що в Канаді, а в 1960–1967 рр. був вихователем новиків у монастирі св. Йосафата у Ґлен-Ков, США. Також служив парохом церкви св. Миколая у Чікаго. Потім – знову викладач і професор у семінарії в Пітсбурзі.
У 1979–1982 рр. о. Пекар був заступником керівника українського відділу Ватиканського Радіо і майже щотижня проводив програми, присвячені християнській вірі, історії Церкви, переслідуванням греко-католиків на Батьківщині. Зокрема, про репресії проти Церкви на Закарпатті й Пряшівщині о. Пекар виголосив 77 програм, які вийшли друком у 1982 р. у форматі книги «Ісповідники віри нашої сучасності». У доробку василіянина – сотні статей і десятки книг, особливо знаковими з яких є тритомні «Нариси історії Церкви Закарпаття» (1967, 1997, 2014) і «Досконалий християнин. Чернечий ідеал св. Василія Великого» (1968, 2005). Його наукову спадщину вирізняють використання архівних матеріалів різними мовами, глибокий аналіз, а також свідома – підкріплена ґрунтовним багатолітнім вивченням джерел, українська позиція. Отець Пекар був автором і співредактором «Записок ЧСВВ», видав багато документів з історії Церкви. Найбільше його праць опубліковані українською, англійською та латинською мовами.
У 1990–1996 рр. о. Атанасія Пекаря обрали протоконсультором Василіянського Чину св. Йосафата. Із 1996 р. він перебував у монастирі св. Йосафата в Ґлен-Ков і плідно працював, незважаючи на хворобу ніг. Отець Атанасій відійшов до Господа 28 вересня 2011 р. на 89 році життя. Похований на українському католицькому кладовищі у Кампбелл-Голл, що у Гемптонбурзі, штат Нью-Йорк.